藥用凍干機一般均在同一個干燥箱體內的一組擱板上完成預凍、保溫、升華干燥全部工藝過程。由于同一組擱板既要具備制冷又要實現加溫，凍干機所以一般均采用中間媒介進行間接傳導，擱板溫度不均勻和托盤導熱不良好的問題導致能耗大、工藝過程長、沒有達到產品設計殘余含水量標準等問題是長期困繞制藥企業發展的一個關鍵因素。

     藥用凍干機根據各個生物制品的特性要求，配合相應的凍干工藝技術處理，使制品物理結構不變，化學結構變化很小，生物制品保持原有的固體結構和形態，在升華干燥過程中，固體冰晶升華成水蒸氣后在制品中留下孔隙，形成海綿狀多孔性結構，具有理想的速溶性和近乎*的復水性。

    凍干機一般都將原料裝在托盤內放置在擱板上的托盤內進行凍結、升華干燥、解析干燥的加工，托盤的厚度應要考慮到冷熱變形，因此不能太薄，一般在1.5mm左右，裝有Y品的西林瓶或食品在托盤內盛裝高度約10-15Mm左右，溫度由擱板的冷熱溫度傳遞到托盤底部開始直到上端的凍結、升華干燥、解析干燥物品為止。但由于裝有藥品的西林瓶、Y品、小型凍干機生物制品或食品在托盤內盛裝高度約10-15mm左右，溫度的傳遞需要較長時間，再由于擱板溫度不均勻，造成了凍干產品含水率不均勻，產品殘余含水量的合格率受影響。

     很多凍干制品的生產需要用到冷凍干燥機，合理而有效地縮短凍干的周期在工業生產上具有明顯的經濟價值。經冷凍干燥處理的物品易于長期保存，加水后能恢復到凍干前的狀態并保持原有的生化特性。為了使藥用冷凍干燥機向著更有利于產品生產的方向發展，并且能夠在確保產品質量的同時，提高生產效率、減少資源浪費和方便生產操作。